Susanne Doll studierte an der Staatlichen Hochschule für Musik in München bei Hedwig Bilgram (Orgel und Cembalo), bei Harald Genzmer (Komposition) und bei Aldo Schoen (Klavier).
Nach Meisterkursen in Orgel bei Michael Radulescu, Marie-Claire Alain und Flors Peeters wurde Susanne Doll 1976 als Orgeldozentin an die Fachakademie für Kirchenmusik nach Bayreuth berufen. Ab 1978 Bezirkskantorin an der Christuskirche Landshut. Seit 1991 ist sie Titularorganistin der Basler Paulus- und Leonhardskirche.
Susanne Doll beschäftigt sich intensiv mit dem Oeuvre von J. S. Bach, O. Messiaen und M. Dupré. Daneben fertigt sie Bearbeitungen von Orchesterwerken für Orgel an, in den letzten Jahren vor allem Instrumentalwerke von J. S. Bach, momentan „La mer“ von C. Debussy.